La coordinación, tanto interna como externa, es una de las acciones que se llevan a cabo desde el programa Arco Iris. Por una parte el equipo que forma el mismo se reúne de forma periódica, para establecer criterios comunes y evaluar la consecución de las actividades y objetivos con el fin de ajustarlos en el caso que se considere necesario. Asimismo, para que la atención sea estable, de complementación y lo más especializada posible, evitando duplicidades, competencias entre los recursos y descoordinación, se mantiene una coordinación continuada con las diferentes entidades que en mayor o menor medida intervienen con las familias atendidas.